Le contrôleur est l'unité de commande centrale d'une installation Matter®. Il met en service, gère et commande des appareils. La plupart du temps, une centrale Smarthome remplit cette tâche. Elle peut apparaître comme un hub séparé ou être intégrée dans d'autres appareils tels que des enceintes intelligentes ou des téléviseurs. Des contrôleurs purement logiciels sont également possibles. Ils fonctionnent comme serveur sur un ordinateur ou une application sur le smartphone. La fonction de contrôleur est généralement liée à une plateforme. Ainsi, les contrôleurs Apple ne conviennent que pour le contrôle dans l'écosystème Apple, les unités centrales Amazon exclusivement à Alexa, les contrôleurs Samsung à SmartThings, etc. Si plusieurs plates-formes doivent être exploitées en parallèle, au moins un contrôleur du système respectif est nécessaire. Cependant, un nombre illimité de contrôleurs peut être installé par plateforme. Pour le protocole Thread®, un Border-Router est nécessaire. Cela signifie qu'un Border-Router a toujours besoin d'un contrôleur Matter®, mais tous les contrôleurs Matter® ne disposent pas nécessairement d'une fonctionnalité Border-Router.